San Giovanni Rotondo ist das Spiritualitätszentrum von Gargano, wo die Pilger jedes Jahr ankommen, um am Grabmal von Pater Pio von Pietrelcina zu beten.
Die Stadt liegt in einer landwirtschaftlich gut ausgenutzten Senke im Südosten von Monte Castellano, am Südhang, und sie blickt auf Manfredonia.
San Giovanni ist berühmt für die Wallfahrtkirche von Pater Pio und das von ihm gewollte Krankenhaus Casa Sollievo della Sofferenza. Aufgrund des Klosters, wo Pater Pio lebte und die Wundmale hatte, ist die Stadt seit mehr als 50 Jahren das Ziel für viele Pilger aus aller Welt.
